Le Secrétariat Exécutif est l’organe d’exécution de la COMIFAC. Il en est composé d'un

• Secrétaire Exécutif;

• Secrétaire Exécutif adjoint- Coordinateur technique;

• Directeur Administratif et financier et

• Un personnel d'appui.

Le Secrétariat Exécutif a pour missions :

• D'assurer la coordination de la mise en œuvre des activités de la COMIFAC;

• D'appliquer les décisions du Conseil des Ministres.